从2017年7月1日起，爱沙尼亚将接替马耳他，成为今年下半年的欧盟轮值主席国，其确定的指导原则是“平衡下的团结”（Unity through balance）。爱沙尼亚担任轮值主席国期间确定的四大优先工作事项包括：建设开放和创新的欧洲经济，维护欧洲安全，建设数据自由流动的数字化欧洲，打造包容性和可持续发展的欧洲。

欧盟理事会主席由各成员国轮流担任，称为欧盟轮值主席国，任期半年，顺序基本按本国文字书写的国名字母排列。英国因“脱欧”于2016年7月20日宣布放弃担任2017年下半年欧盟轮值主席国，欧盟于2016年7月27日作出决定，不指定特定国家代为执行，而由原先排在英国之后的爱沙尼亚往前递补。